Depois de anos usando o Plone, só hoje descobri como apagar as alterações feitas pelo ZMI no portal_view_customizations do Plone (aquelas que ficam em amarelo) , restaurando o template original.

Entre no portal_view_customizations pelo ZMI, clique na aba contents e exclua o item que desejar.

Ok, eu sou noob. Mas se você caiu de para-quedas aqui pelo Google procurando por isso, você também é.